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利用全基因组和EST数据开发多态性EST-SSR标记的方法

价格:¥  40000  万元

公开号:CN104673884A

专利(申请号):CN201410235537.6

所属行业:

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专利交易信息

专利名称 利用全基因组和EST数据开发多态性EST-SSR标记的方法     
国内专利
申请号/专利号
(例如:CN,JP)
CN201410235537.6 专利权人 四川农业大学
申请日 授权日
公开(公告)号
(例如:CN,JP)
CN104673884A 法律状态 已授权
行业分类 一级    二级    三级 
意向价格 40000 万元 权属人所属地域 省    市    区 
IPC分类 一级    二级    三级 
专利类别 发明
是否有PCT 选项:
合作方式 技术转让 
专利摘要
本发明公开了利用全基因组和EST数据开发多态性EST-SSR标记的方法,属于分子生物学领域。本发明首先获取基因组序列与EST数据;接着在全基因组中搜索SSR位点,并鉴定、筛选基因组单一SSR位点;然后设计单一SSR位点比对引物,以EST序列数据为模版进行比对;统计比对结果,筛选在EST模板中有2个以上模拟扩增产物且具有多态性的SSR位点;最后设计多态性EST-SSR位点引物,得到多态性EST-SSR标记。利用本发明开发EST-SSR标记高效、简便,并且能防止因供验证的基因组序列或实验材料遗传差异不足而淘汰掉具有潜在利用价值的EST-SSR标记。所开发的EST-SSR标记与单一基因紧密关联,具有更高的遗传与育种应有价值。

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